In Idle Area 51, i giocatori assumono il ruolo di gestire un'operazione segreta dedicata al recupero della tecnologia aliena da un UFO precipitato. L'obiettivo principale è raccogliere quanta più tecnologia extraterrestre possibile e trasportarla in una struttura di ricerca segreta situata nel deserto. Man mano che il giocatore avanza, costruisce la propria operazione da zero, sbloccando vari segreti e tecnologie aliene nel processo.
I giocatori inizieranno con risorse limitate e dovranno sviluppare strategicamente la propria struttura ricercando aspetti come la biologia aliena, la meccanica degli UFO, le tecnologie avanzate delle armi e il potenziale per i viaggi interstellari. Con ogni avanzamento, possono ottenere finanziamenti aggiuntivi da una misteriosa divisione governativa che supervisiona le operazioni relative agli incontri extraterrestri. Massimizzare l'efficienza della struttura implica accelerare i processi, acquisire più veicoli per il trasporto, aumentare le capacità di ricerca e formare il personale per gestire le crescenti richieste dell'operazione.
Tuttavia, i giocatori devono rimanere vigili mentre si impegnano nelle loro ricerche. La minaccia di incontri con alieni incombe e la presenza di personaggi come i Ragazzi in Nero aggiunge un intrigante livello di pericolo. Come parte del gioco, i giocatori possono avviare campagne di disinformazione per distrarre il pubblico dai loro sforzi e devono anche prepararsi a potenziali incursioni nelle loro strutture. Essere proattivi nel proteggere le proprie attività da queste minacce è essenziale per un successo continuo.
Inoltre, i giocatori possono migliorare le proprie operazioni utilizzando le risorse scoperte attraverso gli Star Gate intergalattici e gli enigmatici Quasar. Questi elementi non solo aggiungono profondità al gameplay, ma offrono anche l'opportunità di aggiornare le strutture e migliorare l'efficienza complessiva. I giocatori sono incoraggiati a pensare in modo strategico ai propri investimenti per mantenere un vantaggio competitivo nelle loro attività di ricerca gestendo al tempo stesso i rischi in modo efficace.
In definitiva, il gioco pone i giocatori al controllo del proprio destino nel regno clandestino dell'Area 51. Le scelte fatte influenzeranno direttamente i risultati operativi, influenzando la crescita dei ricavi, la gestione dei costi e il successo complessivo della loro missione. Mentre i giocatori si addentrano sempre più nei misteri della tecnologia aliena, si trovano ad affrontare decisioni che potrebbero avere un impatto non solo sulle loro operazioni ma anche sul destino del mondo stesso.