Idle Area 51-ში მოთამაშეები ასრულებენ ფარული ოპერაციის მართვის როლს, რომელიც ეძღვნება უცხოპლანეტელების ტექნოლოგიების გადარჩენას ავარიული უცხოპლანეტელებისგან. უპირველესი მიზანია რაც შეიძლება მეტი ამ არამიწიერი ტექნოლოგიის შეგროვება და მისი უკან დაბრუნება უდაბნოში მდებარე საიდუმლო კვლევით ობიექტში. როგორც მოთამაშე პროგრესირებს, ისინი აყალიბებენ თავიანთ ოპერაციას თავიდანვე, ამ პროცესში ხსნიან უცხოპლანეტელების სხვადასხვა საიდუმლოებას და ტექნოლოგიებს.
მოთამაშეები დაიწყებენ შეზღუდული რესურსებით და სტრატეგიულად უნდა განავითარონ თავიანთი შესაძლებლობები ისეთი ასპექტების გამოკვლევით, როგორიცაა უცხოპლანეტელების ბიოლოგია, უცხოპლანეტელები მექანიკა, იარაღის მოწინავე ტექნოლოგიები და ვარსკვლავთშორისი მოგზაურობის პოტენციალი. ყოველი წინსვლისას მათ შეუძლიათ მიიღონ დამატებითი დაფინანსება იდუმალი სამთავრობო განყოფილებისგან, რომელიც ზედამხედველობს ოპერაციებს, რომლებიც დაკავშირებულია არამიწიერ შეტაკებებთან. ობიექტის ეფექტურობის მაქსიმიზაცია მოიცავს პროცესების დაჩქარებას, ტრანსპორტირებისთვის მეტი სატრანსპორტო საშუალების შეძენას, კვლევის შესაძლებლობების გაზრდას და პერსონალის მომზადებას ოპერაციის მზარდი მოთხოვნების დასაკმაყოფილებლად.
თუმცა, მოთამაშეები უნდა იყვნენ ფხიზლად, როდესაც ისინი ერთვებიან თავიანთ კვლევაში. უცხოპლანეტელებთან შეტაკებების საშიშროება ჩნდება და ისეთი პერსონაჟების არსებობა, როგორიცაა ბიჭები შავებში, საფრთხის დამაინტრიგებელ ფენას მატებს. როგორც გეიმპლეის ნაწილი, მოთამაშეებს შეუძლიათ წამოიწყონ დეზინფორმაციული კამპანიები, რათა საზოგადოების ყურადღება გადაიტანონ თავიანთი მცდელობებისგან და ასევე უნდა მოემზადონ პოტენციური რეიდებისთვის მათ ობიექტებზე. ამ საფრთხეებისგან მათი ოპერაციების დასაცავად პროაქტიული ყოფნა აუცილებელია უწყვეტი წარმატებისთვის.
უფრო მეტიც, მოთამაშეებს შეუძლიათ გააძლიერონ თავიანთი ოპერაციები გალაქტიკათშორისი ვარსკვლავური კარიბჭის და იდუმალი კვაზარების მეშვეობით აღმოჩენილი რესურსების გამოყენებით. ეს ელემენტები არა მხოლოდ მატებს თამაშს სიღრმეს, არამედ იძლევა შესაძლებლობების განახლებისა და საერთო ეფექტურობის გაუმჯობესების შესაძლებლობებს. მოთამაშეებს ურჩევენ, სტრატეგიულად იფიქრონ თავიანთ ინვესტიციებზე, რათა შეინარჩუნონ კონკურენტული უპირატესობა თავიანთ კვლევაში, რისკების ეფექტურად მართვის დროს.
საბოლოოდ, თამაში ათავსებს მოთამაშეებს აკონტროლებენ თავიანთ ბედს ფარულ ზონაში 51. მიღებული არჩევანი პირდაპირ გავლენას მოახდენს ოპერაციულ შედეგებზე, გავლენას მოახდენს შემოსავლების ზრდაზე, ხარჯების მართვასა და მათი მისიის საერთო წარმატებაზე. როდესაც მოთამაშეები უფრო ღრმად იკვლევენ უცხოპლანეტელების ტექნოლოგიების საიდუმლოებებს, ისინი ხვდებიან გადაწყვეტილებებს, რომლებიც პოტენციურად გავლენას მოახდენს არა მხოლოდ მათ მუშაობაზე, არამედ თავად სამყაროს ბედზეც.