I Idle Area 51 tar spelarna på sig rollen att hantera en hemlig operation dedikerad till att rädda utomjordisk teknologi från ett kraschat UFO. Det primära målet är att samla så mycket av denna utomjordiska teknologi som möjligt och transportera tillbaka den till en hemlig forskningsanläggning i öknen. Allt eftersom spelaren går framåt bygger de upp sin verksamhet från grunden och låser upp olika utomjordiska hemligheter och tekniker i processen.
Spelare kommer att börja med begränsade resurser och måste strategiskt utveckla sin anläggning genom att undersöka aspekter som utomjordisk biologi, UFO-mekanik, avancerad vapenteknologi och potentialen för interstellära resor. Med varje framsteg kan de säkra ytterligare finansiering från en mystisk regeringsavdelning som övervakar operationerna relaterade till utomjordiska möten. Att maximera effektiviteten i anläggningen innebär att påskynda processer, skaffa fler fordon för transport, öka forskningskapaciteten och utbilda personal för att hantera de eskalerande kraven från verksamheten.
Men spelarna måste vara vaksamma när de engagerar sig i sin forskning. Hotet om främmande möten skymtar, och närvaron av karaktärer som Guys in Black lägger till ett spännande lager av fara. Som en del av spelet kan spelare initiera desinformationskampanjer för att distrahera allmänheten från deras ansträngningar och måste också förbereda sig för potentiella räder mot deras anläggningar. Att vara proaktiv för att skydda sin verksamhet mot dessa hot är avgörande för fortsatt framgång.
Dessutom kan spelare förbättra sin verksamhet med hjälp av resurser som upptäckts genom intergalaktiska Star Gates och gåtfulla kvasarer. Dessa element ger inte bara djup till spelet utan ger också möjligheter att uppgradera faciliteter och förbättra den totala effektiviteten. Spelare uppmuntras att tänka strategiskt kring sina investeringar för att behålla en konkurrensfördel i sina forskningsaktiviteter samtidigt som de hanterar risker effektivt.
I slutändan placerar spelet spelare i kontroll över sitt öde inom det hemliga området Area 51. De val som görs kommer direkt att påverka de operativa resultaten, påverka intäktstillväxt, kostnadshantering och den övergripande framgången för deras uppdrag. När spelare dyker djupare in i utomjordisk tekniks mysterier ställs de inför beslut som potentiellt kan påverka inte bara deras verksamhet utan också världens öde.