Ứng dụng Penly có giao diện thân thiện với người dùng và đơn giản được thiết kế để dễ sử dụng. Nó cung cấp một trải nghiệm chữ viết tay trơn tru được bổ sung bởi một cục tẩy thông minh, cho phép ghi chú và vẽ trực quan. Người dùng có quyền truy cập vào các công cụ khác nhau bao gồm các tùy chọn cho văn bản, hình ảnh và hình dạng. Ứng dụng cũng cung cấp khả năng tạo ra các bộ sưu tập nhãn dán độc đáo và nhập phông chữ tùy chỉnh, tăng cường cá nhân hóa. Ngoài ra, một tính năng nhận dạng chữ viết tay tự động đáng chú ý chuyển đổi ghi chú viết tay thành văn bản được đánh máy, đồng thời làm nổi bật và nhấn mạnh các công cụ tạo điều kiện cho việc tổ chức nội dung tốt hơn. Người dùng có thể dễ dàng chuyển đổi, nhóm và khóa đối tượng và tận dụng chức năng hoàn tác và làm lại để quản lý sáng tạo của họ một cách hiệu quả.
Penly bao gồm bốn nhà hoạch định kỹ thuật số phục vụ cho các nhu cầu lập kế hoạch đa dạng. Những nhà hoạch định này đi kèm với các trang hàng tháng, hàng tuần và hàng ngày, khiến việc điều hướng dễ dàng. Các nhà hoạch định không được đánh dấu, cho phép người dùng viết vào ngày của riêng họ và có thể tái sử dụng cho nhiều chu kỳ lập kế hoạch. Chúng có sẵn trong cả hai định hướng cảnh quan và chân dung, được cung cấp theo cầu vồng sôi động và phong cách đen tối giản. Các mẫu bao gồm cho danh sách việc cần làm và ghi chú tiếp tục nâng cao trải nghiệm lập kế hoạch, cung cấp cấu trúc và tính linh hoạt cho người dùng.
Ứng dụng cho phép nhập liền mạch các tệp và nhà hoạch định PDF, cho phép người dùng làm việc với các tài liệu hiện có một cách dễ dàng. Người dùng có thể điều hướng thông qua các tệp PDF đã nhập bằng các siêu liên kết và họ có tùy chọn xuất các chỉnh sửa của họ dưới dạng tệp PENly có thể chỉnh sửa hoặc dưới dạng tài liệu PDF tiêu chuẩn. Hơn nữa, người dùng có thể tạo các siêu liên kết của riêng họ trong bất kỳ tài liệu nào, chuyển đổi bất kỳ đối tượng nào thành một liên kết có thể nhấp sang các trang khác hoặc các trang web bên ngoài, từ đó tăng cường chức năng và tính tương tác trong các ghi chú và dự án của họ.
Tổ chức là một tính năng chính của ứng dụng Penly, vì nó cho phép người dùng quản lý ghi chú và tài liệu của họ một cách hiệu quả. Người dùng có thể sao chép, dán, xóa và sắp xếp lại các trang, cùng với việc quản lý tài liệu của họ thông qua các thư mục và trình phụ. Các tài liệu tự động mở lại tại điểm truy cập cuối cùng, đảm bảo một quy trình làm việc trơn tru. Để nâng cao trải nghiệm người dùng, ứng dụng hỗ trợ đồng bộ hóa trên các thiết bị Android thông qua Google Drive, với các tùy chọn để đồng bộ hóa thủ công hoặc tự động. Với sự hỗ trợ ngôn ngữ mạnh mẽ hiện chỉ giới hạn ở tiếng Anh, người dùng được khuyến khích tham gia với cộng đồng để hỗ trợ và chia sẻ phản hồi, bao gồm cả kinh nghiệm của họ để giúp thúc đẩy cải tiến liên tục ứng dụng.