W Idle Area 51 gracze wcielają się w kierowanie tajną operacją mającą na celu uratowanie obcej technologii z rozbitego UFO. Głównym celem jest zebranie jak największej ilości tej pozaziemskiej technologii i przetransportowanie jej z powrotem do tajnego ośrodka badawczego zlokalizowanego na pustyni. W miarę postępów gracz buduje swoją działalność od podstaw, odblokowując przy tym różne tajemnice i technologie obcych.
Gracze rozpoczynają z ograniczonymi zasobami i muszą strategicznie rozwijać swój obiekt, badając takie aspekty, jak biologia obcych, mechanika UFO, zaawansowane technologie broni i potencjał podróży międzygwiezdnych. Z każdym postępem mogą zapewnić sobie dodatkowe fundusze od tajemniczego wydziału rządowego, który nadzoruje operacje związane ze spotkaniami z istotami pozaziemskimi. Maksymalizacja wydajności obiektu obejmuje przyspieszenie procesów, zakup większej liczby pojazdów do transportu, zwiększenie możliwości badawczych i przeszkolenie personelu, aby mógł sprostać rosnącym wymaganiom operacji.
Gracze muszą jednak zachować czujność podczas prowadzenia badań. Grozi spotkaniem z obcymi, a obecność postaci takich jak Faceci w Czerni dodaje intrygującą warstwę niebezpieczeństwa. W ramach rozgrywki gracze mogą inicjować kampanie dezinformacyjne, aby odwrócić uwagę opinii publicznej od swoich wysiłków, a także muszą przygotować się na potencjalne naloty na ich obiekty. Bycie proaktywnym w ochronie swojej działalności przed tymi zagrożeniami jest niezbędne dla dalszego sukcesu.
Co więcej, gracze mogą usprawnić swoje działania, korzystając z zasobów odkrytych przez międzygalaktyczne Gwiezdne Wrota i tajemnicze Kwazary. Elementy te nie tylko dodają głębi rozgrywce, ale także stwarzają możliwości ulepszania obiektów i poprawy ogólnej wydajności. Zachęcamy graczy do strategicznego myślenia o swoich inwestycjach, aby utrzymać przewagę konkurencyjną w swoich badaniach naukowych, jednocześnie skutecznie zarządzając ryzykiem.
Ostatecznie w grze gracze mają kontrolę nad swoim przeznaczeniem w tajnej krainie Strefy 51. Dokonane wybory będą miały bezpośredni wpływ na wyniki operacyjne, wpływając na wzrost przychodów, zarządzanie kosztami i ogólny sukces ich misji. W miarę jak gracze zagłębiają się w tajemnice obcej technologii, stają przed decyzjami, które mogą potencjalnie wpłynąć nie tylko na ich działanie, ale także na losy samego świata.